Буэнос-Айрестегі мұсылман көшбасшылары Бергольоның папа болып сайлануы туралы хабарды қуана қабылдады, ол "әрқашан өзін ислам қауымының досы ретінде көрсеткенін" және оның ұстанымы "диалогты қолдайтын" адам екенін атап өтті. Олар Бергольоның мұсылман топтарымен тығыз байланысын мақтады және Рим папасы Бенедикттің 2006 жылғы Регенсбургтегі дәрісінде айтқан пікірлерін атап өтті.
Көптеген адамдар оны исламды қорлау деп түсіндірді. Олардың айтуынша, Бергольо Бенедикттің сөзінен бірден бас тартты және мұсылмандарға наразылық туғызған мәлімдемелер "Папа Иоанн Павел II соңғы 20 жылда құрған исламмен қарым-қатынастың мұқият құрылымын 20 секунд ішінде жоюға қызмет етеді" деді.