Жапондықтар берілсе де, мәселені одан әрі қиындата түседі
тамыз айының ортасында Достасқан әскерлер 29 қыркүйекке дейін Голландиялық Шығыс Үндістанға жетпеді. Соғыстың аяқталуы мен одақтас әскерлердің келуі арасындағы билік вакуумы индонезиялық ұлтшылдарға билікті өз қолына алуға жеткілікті уақыт берді және олар 17 тамызда тәуелсіздік жариялады, президенті ретінде Сукарно болды. Индонезиядағы жағдай хаотикалық болды және көтерілісші топтар, олардың көбі жапондықтар әскери даярлықтан өткен, тұтқындарға, негізінен голландиялықтарға, шабуыл жасай бастады.