2006 жылы Супер Агури Монтаньиді үшінші жүргізуші етіп алды; алайда, ол мамыр айында Юдзи Идедің тестілеуге қайта оралуы туралы хабарланғаннан кейін толық жарыс жүргізушісі болды; Иде оны Формула-1 үшін жеткілікті тәжірибелі деп есептемеген басқарушы органның тапсырысы бойынша төмендетілді. Осылайша Монтаньи өзінің алғашқы Гран-приі - 2006 жылғы Еуропа Гран-приінде жарысқа шықты.
7 мамырда соңғы орынды иеленіп, гидравлика мәселесімен тоқтады. Ол екінші жарысын аяқтамады 2006 жылғы Испания Гран-приі: керемет басталғаннан кейін, оған 3 орын алуға мүмкіндік берді, ол 10-айналмада механикалық ақаумен зейнеткерлікке шықты. Ол Монако Гран-присінде үшінші рет сәтті болды, ол 78 айналымдық жарысты 16-шы орында аяқтады, көшбасшыдан үш айналым артта қалды.