Келесі сөйлемді аяқтаңыз: 2006 жылдың 15 ақпанында Папа Бенедикт XVI оны Мысырдағы Апостольдық Нунций және Араб мемлекеттері лигасының өкілі етіп тағайындады, бұл оның алғашқы дипломатиялық қызметі болды. Ол Рим папасының шіркеу академиясына қатыспаған санаулы нунцийлердің бірі болды. Би-би-сидің хабарлауынша, "Германияда туған папаның шешімі үлкен шатастыруға себеп болды. Ватиканның бақылаушылары бұл шараның архиепископтың мәртебесін төмендету ме, әлде оның ерекше талантын мойындау ма екендігін анықтауға тырысуда". Фицджеральд былай деді: "Араб және ислам зерттеулеріндегі білімім қазіргі уақытта Мысырмен және ислам әлемінің қалған бөлігімен қарым-қатынасты дамыту үшін пайдалы деп саналады". Бір Ватикан тілшісі Фицджеральдтың ауысуын "Папаның ең нашар шешімі" деп атады, ал оның болмауы прессада Папа Бенедикт мұсылмандарды ренжіткен кезде байқалды
2006 жылдың қыркүйек айында Регенсбургте өткен лекция. Фицджеральдтың ауысуы Бенедикттің Куриалдық бөлімдерді қайта құрылымдауының бір бөлігі болып шықты. Бұл Бенедикттің 2006 жылдың наурызында бастаған және 2007 жылдың маусым айында кері бұрылған ПЦИД президенті рөлін Мәдениет жөніндегі понтификалық кеңестің рөлімен біріктіру арқылы христиан еместермен дінаралық талқылауларды қайта бағыттау.