Сергей Юшенков 2003 жылы 17 сәуірде Мәскеудегі үйінің жанында атып өлтірілді. Бұл оның "Либералды Ресей" партиясының 2003 жылғы желтоқсанда 55 аймақтағы парламент сайлауына қатысу үшін қажетті тіркеуден өткеніне бірнеше сағат өткен соң болды. Соңғы рет ол: "Тіркеу аяқталды" деп жариялады. Михаил Трепашкин Юшенков ФСБ мен Ресей билігінің билігіне ашық қарсы шыққан оппозициялық партияның жетекшісі болғандықтан өлтірілген деп сенді. Сонымен қатар, Юшенков сайлаушыларға ресейлік пәтердегі бомбалау оқиғасын тәуелсіз тергеуге уәде берді.
Бұл оның сайлау науқанының басты мәселесі болды (Трепашкиннің сұхбатын режиссер Андрей Некрасовтың "Сынысқа сенбеу" атты деректі фильмінде көруге болады, Google Video).