2011 жылдың маусым айында Виллас-Боас "Портудан" кетіп, "Челсидің" жаттықтырушысы болды. Ол өзінің техникалық қызметкерлерін Лондонға, клубтың жаңа жаттықтырушысы болған көмекші жаттықтырушысы Витор Перейрадан басқа, алды. Оның алғашқы еуропалық матчы 2011 жылғы УЕФА Суперкубогы үшін "Барселонаға" қарсы болды.
. Монакодағы үшінші кездесуінде "Порту" 2:0 есебімен жеңіліп, екінші орынды иеленді. Олар 2011-12 жылғы УЕФА Чемпиондар Лигасының топтық кезеңінен өтпеді, APOEL және Зенит Санкт-Петербургке жеңіліске ұшырағаннан кейін, олар топ жеңімпаздары мен екінші орынға ие болды. УЕФА Еуропа Лигасының 32-ші раундына ауысты, қорғаныстағы чемпиондар Манчестер Ситиге 6-1 есебімен ұтылып қалды. Динамо Загреб пен Динамо Киевтен тұратын топта Париж Сен-Жерменнен кейін екінші орынға ие болған Порто оныншы раундқа жолдама алды, онда олар турнирдің дебютанттары Малагамен кездесті. Бірінші таймда 1:0 есебімен жеңіске жеткен "Порту" "Ла Розаледа" стадионында 2:0 есебімен жеңіліп, шығып кетті. Өз тобында Atlético Madrid және Zenit Санкт-Петербургтен кейінгі үшінші орынға ие болған "Порту" УЕФА Еуропа лигасына түсіп қалды. Олар ширек финалда Севильядан жеңілді.