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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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| 439
|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
TACGGAGGGTGCAAGCGTTATCCGGATTCACTGGGCTTAAAGGGTGCGTAGGTGGGCAGGCAAGTCAGTGGTGAAATCTCCGGGCTTAACTCGGAAACTGCCATTGATACTAGCTTTCTTGAATACCGTGGAGGTCAGCGGAATATGTCATGTAGCGGTGAAATGCTTAGATATGACATAGAACACCAATTGCGAAGGCAGCTGGCTGCACGAATATTGACACTGATGCACGAAAGCGTGGGGATCAAACAGG
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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|
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| 1,508
|
URS0001FB1770
|
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| 497
|
URS0000B677DA
|
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| 1,418
|
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in Data Studio
This is a parquet-ified subset of the RNAcentral active fasta file available here: https://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/RNAcentral/releases/24.0/sequences/rnacentral_active.fasta.gz
I have preprocessed it a bit, requiring only sequences less than 8192 nt long, and having no ambiguous nucleotides (i.e. no Ns or other non standard things)
This dataset is about 10% of the overall, and comprises 3,252,483 (3.2 million) sequences, or 2,642,703,990 (2.6 billion) bases.
The train/val/test split is 60/20/20
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